Pagrindinė Šiuolaikinės mokyklos centro mokymo bazė – 1516,20 m2 ploto pastatas Žygimantų g. 4/2.

2003 metais pastatą iš esmės renovavome, taip pat, pastatėme ir įrengėme dar vieną aukštą. Sukūrėme papildomą 409 m2 plotą, įrengėme 5 naujus, šiuolaikinius reikalavimus atitinkančius mokymo kabinetus, naują mokytojų kambarį bei pagalbines patalpas. Taip pat iš esmės buvo renovuota šildymo (viso pastato) bei įrengta naujojo aukšto vėdinimo sistema.

Kita vertus, dirbame ir mokomės ne vien įprastinėje mokyklinėje aplinkoje. Palaipsniui atsisakydami tradicinio tvarkaraščio, keisdami jį projektinėmis bei modulinėmis praktikomis ir individualiomis programomis, siekiame ugdymui maksimaliai naudoti ir nemokyklinę aplinką. Organizuodami ugdymą bendradarbiaujame su Lietuvos policijos mokymo centro stadionu (Kalnų parke), Š.Marčiulionio krepšinio akademija, UAB “Vilniaus vandenys” Vandens kokybės tyrimo laboratorija, Lietuvos muzikos akademija, Pilietinių iniciatyvų centru, Vilniaus universiteto Teorinės fizikos ir astronomijos institutu, Vilniaus universiteto Gamtos fakulteto Žmogaus genetikos laboratorija, Onkologijos instituto Kraujo tyrimo laboratorija, Lietuvos laisvos rinkos institutu, Vilniaus pedagoginio universiteto Teorinės fizikos ir kompiuterijos katedra, Lietuvos Mokslų akademijos biblioteka, „Elfų“ teatru, Lietuvių kalbos institutu, Nacionaliniu muziejum, Taikomosios dailės muziejum, A. Mickevičiaus muziejum, Genocido muziejum, Vilniaus planetariumu.